Estabilidade do dna mitocondrial na superfície de fezes de veado-catingueiro (Subulo gouazoubira) no bioma da caatinga

Abstract

A caracterização da qualidade da obtenção de DNA a partir de amostras fecais consiste em um desafio para otimização de estudos voltados para os cervídeos na região da Caatinga. Portanto, o presente estudo tem como objetivo avaliar a estabilidade do DNA mitocondrial em fezes de Subulo gouazoubira expostas à incidência solar por até 30 dias. Amostras de fezes foram coletadas por meio de técnica não invasiva, obtidas de quatro fêmeas de veado-catingueiro mantidas sob cuidados humanos, alojadas nas instalações do LACCERNE da UECE. Foram separados três grupos experimentais distintos baseados na quantidade de cíbalos (1, 3 e 5 unidades), onde as amostras de DNA foram obtidas nos dias 0, 10, 20 e 30, coletadas com auxílio de Swab. As amostras de DNA recuperadas foram analisadas por meio da técnica de PCR em tempo real (qPCR). Foram amplificados os genes mitocondriais ATP6 (subunidade 6 da enzima ATP sintase) e ND5 (subunidade 5 da enzima NADH desidrogenase). As temperaturas médias apresentaram tendência de redução ao longo do período experimental (janeiro/fevereiro de 2026), variando de 36,2 °C no início do experimento para 29,5 °C ao final dos 30 dias. Observou-se correlação inversa entre o aumento da temperatura acumulada e a concentração de DNA recuperada ao longo do tempo. A quantificação realizada por espectrofotometria mostrou que as concentrações iniciais de DNA foram maiores quando utilizou-se três e cinco cíbalos (47,0 e 50,6 ng/µL, respectivamente) em comparação a um cíbalo (17,3 ng/µL). Entretanto, observou-se redução nas concentrações ao longo do tempo de exposição ambiental, indicando possível degradação do DNA devido à ação de fatores ambientais como temperatura e umidade. Para o gene mitocondrial ND5, as concentrações no dia 0 foram de 45,0 ng/µL (1 cíbalo), 165,0 ng/µL (3 cíbalos) e 1375,1 ng/µL (5 cíbalos). Ao longo dos dias, o grupo de três cíbalos teve as seguintes concentrações: 2,76 ng/µL no dia 10, 6,99 ng/µL no dia 20 e 5,17 ng/µL no dia 30. No grupo de cinco cíbalos foram registradas as seguintes concentrações: 2,94 ng/µL, 4,19 ng/µL e 3,33 ng/µL nos mesmos períodos, respectivamente. Para o gene ATP6, foram registrados valores iniciais mais elevados, com 20.035,1 ng/µL (1 cíbalo) e 32.564,1 ng/µL (3 cíbalos). Ao longo do tempo de exposição ambiental, observou-se redução acentuada destas concentrações. Para o ATP6, no grupo de cinco cíbalos, a concentração inicial superior a 36 milhões de ng/µL reduziu para 7,8 ng/µL no dia 10, 8,8 ng/µL no dia 20 e 4,2 ng/µL no dia 30, evidenciando intensa degradação inicial do DNA com posterior estabilização dos mesmos em baixos níveis detectáveis por qPCR. Pode-se concluir que a avaliação de DNA mitocondrial por meio de swab de amostras fecais é uma metodologia eficaz para o estudo genético de populações de cervídeos na região da Caatinga.